Le PocketPC que j'utilise (Qtek 9100) ne dipose que d'un processeur à 200Mhz. Il faut donc réencoder les vidéos pour qu'elles soient lisibles et ne saccadent pas.

Pour ça j'utilise MEncoder :

/usr/local/bin/mencoder input_file -o output_file.avi -vf scale=320:240,pp=lb \
-ovc lavc -lavcopts vcodec=mpeg4:vbitrate=256 -oac mp3lame -lameopts abr:br=96

On peut également utiliser ffmpeg. Voir les rubriques 'Encodage' sur cette page (section Vidéo).